Пандемия басталғаннан бері диагностикалық тестілеу SARS-CoV-2, ауру тудыратын вирустың таралуын бақылауда маңызды рөл атқарды.COVID 19.Жылдам антигендік сынақтарүйде немесе клиникалық жағдайда орындалған нәтиже 15 минут немесе одан аз уақыт ішінде береді.Адам неғұрлым ертерек диагноз қойылса, соғұрлым тезірек медициналық көмекке жүгініп, өзін басқалардан оқшаулай алады.Бірақ вирустың жаңа нұсқалары пайда болған кезде, бұл нұсқалар бұл сынақтар арқылы анықталмауы мүмкін.
Көптеген жылдам антиген сынақтары SARS-CoV-2 нуклеокапсидті ақуызды немесе N-белокты анықтауға арналған.Бұл ақуыз вирустық бөлшектерде және жұқтырған адамдарда көп кездеседі.Жылдам сынақ жинағыs әдетте N ақуызының әртүрлі бөліктерімен байланысатын екі түрлі диагностикалық антиденелер бар.Антидене үлгідегі N протеинімен байланысқан кезде сынақ жинағында инфекцияны көрсететін түсті сызық немесе басқа сигнал пайда болады.
Протеин N 419 аминқышқылдарының құрылымдық бірлігінен тұрады.Олардың кез келгені мутация арқылы басқа амин қышқылымен ауыстырылуы мүмкін.Ph.D жетекшілік ететін зерттеу тобы.Филипп Фрэнк пен Эрик Ортлунд Эмори университетінің осы жалғыз аминқышқылының өзгеруі жылдам антиген сынағының өнімділігіне қалай әсер ететінін зерттеуге кірісті.Олар вирустың N ақуызындағы әрбір мутацияның диагностикалық антиденемен байланысуына қалай әсер ететінін бір уақытта бағалау үшін терең мутацияны сканерлеу деп аталатын әдісті пайдаланды.Олардың нәтижелері Cell журналында 2022 жылдың 15 қыркүйегінде жарияланды.
Зерттеушілер шамамен 8000 N ақуыз мутациясының толық кітапханасын жасады.Бұл нұсқалар барлық ықтимал мутациялардың 99,5% -дан астамын құрайды.Содан кейін олар әр нұсқаның 17 түрлі диагностикалық антиденелермен қалай әрекеттесетінін бағалады, оның ішінде 11 коммерциялық қол жетімді жылдам антиген сынақтары, соның ішінде жалпыүй жинақтары.
Команда қандай N-белок мутациялары антиденелерді тануға әсер ететінін бағалады.Осы ақпаратқа сүйене отырып, олар әрбір диагностикалық антидене үшін «қашу мутация профилін» жасады.Бұл профиль антидененің нысанаға байланысу қабілетіне әсер етуі мүмкін N ақуызындағы ерекше мутацияларды анықтайды.Талдау бүгінгі экспресс-тесттерде қолданылатын антиденелер алаңдаушылық пен алаңдаушылық тудыратын SARS-CoV-2 барлық бұрынғы және қазіргі нұсқаларын танитынын және байланыстыратынын көрсетті.
Бірнеше диагностикалық антиденелер N протеинінің бір аймағын танитынымен, зерттеушілер әрбір антидене қашу мутациясының бірегей белгісі бар екенін анықтады.SARS-CoV-2 вирусы мутацияға ұшырап, жаңа нұсқаларды генерациялауды жалғастыратындықтан, бұл деректерді қайта бағалау қажет болуы мүмкін сынақ жинағы антиденелерін белгілеу үшін пайдалануға болады.
«Жұқтырған адамдарды дәл және тиімді анықтау COVID-19 әсерін азайтудың маңызды стратегиясы болып қала береді және біздің зерттеуіміз анықтауға кедергі келтіруі мүмкін болашақ SARS-CoV-2 мутациялары туралы ақпарат береді», - деді Ортлунд.«Мұнда келтірілген нәтижелер бізге осы вирусқа тез бейімделуге мүмкіндік береді, өйткені клиникалық және қоғамдық денсаулыққа дереу әсер ететін жаңа нұсқалар пайда болуды жалғастыруда».
Анықтама: Mutation Deep Scan қазіргі уақытта қол жетімді жылдам антиген сынақтарының көмегімен SARS-CoV-2 нуклеокапсидіндегі қашу мутацияларын анықтайды.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA жасушасы.2022 15 қыркүйек;185(19):3603-3616.e13.Ішкі істер министрлігі: 10.1016/j.cell.2022.08.010.2022 жылғы 29 тамыз PMID: 36084631.
Қаржыландыру: Ұлттық биомедициналық бейнелеу және биоинженерия институты NIH (NIBIB), Ұлттық қант диабеті, ас қорыту және бүйрек аурулары институты (NIDDK) және Ұлттық аллергия және жұқпалы аурулар институты (NIAID), Америка жүрек қауымдастығы.
NIH Research Matters - NIH сарапшылары қараған негізгі NIH зерттеу нәтижелерінің апта сайынғы жаңартылуы.Оны Ұлттық денсаулық сақтау институты директорының коммуникациялар және қоғаммен байланыс бөлімі жариялады.